1884年4月15日， 孫中山轉而入讀香港中央書院， 並以 自己的幼名「孫帝象」註冊。 他就讀7個月後於11月中途綴學前往檀香山， 協助兄長店舖的工作，擔任店員。 到次年1885年8月，他再返回香港中央書院復學。

中央書院建於1862年，是本港的第一所官立中學，提供現代化的西式教育。原址於1893年改建為庇理羅士女校，1957年改建為荷李活道官立小學。1978年成為東華三院黃鳳翎中學校址。現為聖公會基恩小學。

1886年春夏間， 孫中山在中央書院畢業，他決定學醫。經過喜嘉理牧師 (Rev. Hager)的介紹，轉至入讀廣州美基督長老會所辦的博濟醫院附設南華醫學堂讀書。

1883-1885年中法戰爭期間，全國人民都積極參加反法鬥爭中來，各省人名先後焚毀法國教堂和抓捕法國間諜。分散的各國華人華僑夜紛紛捐款，支援祖國的抗法鬥爭。中華民族上下一心，團結互助，終於取得了勝利。戰勝的消息傳遍了全國，孫中山先生很興奮，很激動。這一次，他看到了中華民族的力量，看到了團結一致的真正實力，他知道人民的心中還是存有火種，屢受壓迫的人民總有一天回奮起反抗的！然而，清政府在勝仗的情況下卻卑怯求和，為了盡快結束戰爭，是北京政權不受威脅，與法國簽署了屈辱喪國的《中法新約》，民眾對此感到極其悲憤，香港華人為抗議清政府的做法，在法國軍艦開至香港時，香港工人堅決拒修，碼頭工人罷工。在1884年9月，香港個行業的愛國人士集體舉行罷工，罷市的抗爭活動。法國政府於是聯合了控制香港的英國當局，採取各種手段鎮壓。這更是激起人民的憤怒，掀起了一場大規模的示威活動。清朝廷對待外國列強的軟弱與無能，令孫中山先生悲憤不已，也萌發了他的革命思想。孫中山先生看到滿清政府每次的外交都失敗，內政也腐敗不堪，人們受內外的壓迫，但是他卻無能為力，他希望改變著一切，使中國強大起來，因此推翻清政府的志願，也就一天強似一天。孫中山先生常說： 「畢業後做醫生，還不如學做洪秀全，建立一個新國家，更來得要緊！」所以他除研究醫學書籍外，更自己買了大批的「民族革命史」，法、美兩國革命 史之類的書籍，日夜研究。

1886年，孫中山先生終於完成了他在香港中央書院的學業，拿著畢業證，走出學校大門的一刻，他覺得自己正站在人生的交叉口一樣，面臨著新的學習和考驗。香港的朋友建議他拿錢買個官職，步入官場為國效力，可孫中山對清朝政府的腐敗深感無力，不想涉足其中。檀香山的朋友有建議他投考神學院，做一名基督教的傳教士，顆孫中山先生覺得傳教只能鼓勵安慰人們的精神，卻不能改變社會什麼。正在彷徨的孫中山突然想起了英勇抗敵的士兵和示威反抗的人民流血時的慘況，因為受傷過重無人醫治而死亡，孫中山先生感到了痛惜的不忍，他覺得“醫亦救人之術”，可以保障人民和士兵的健康，於是他毅然決定從事醫學事業。在老師的推薦下，孫先生入讀廣州博濟醫院附設的醫科學校，然而他對學校的制度感到不滿，如在婦科學科只允許外國學生和中國女學生學習。